Система органов государственной службы безопасности:
а) Министерство государственной безопасности в составе структурных подразделений (управления, отделы) осуществляет общее руководство подразделениями, организует их деятельность, издает в пределах своих полномочий нормативные правовые акты, реализует основные направления деятельности органов государственной службы безопасности;
б) подразделения Министерства в городах и районах Приднестровской Молдавской Республики обеспечивают реализацию возложенных на них задач на соответствующей территории;
в) подразделения Министерства в Вооруженных Силах Приднестровской Молдавской Республики, других войсках и иных воинских формированиях (военная контрразведка) решают возложенные на них задачи по обеспечению безопасности в Вооруженных Силах Приднестровской Молдавской Республики, воинских формированиях пограничной охраны, внутренних войсках и иных воинских формированиях, предусмотренных законодательством Приднестровской Молдавской Республики;
г) пограничные органы осуществляют защиту и охрану Государственной границы Приднестровской Молдавской Республики, разведывательную, контрразведывательную и оперативно-розыскную деятельность в целях обеспечения территориального суверенитета и безопасности Приднестровской Молдавской Республики;
д) подразделение специального назначения.